El Comité es un órgano de gestión ante el Consejo. Estará integrado por un representante designado por cada uno de los miembros que conforman el Consejo de Ministros de la EMSA.
| País | Contacto | Institución |
| Belize | Martín Alegría | Chief Environmental Officer at the Department of Environment Ministry of Agriculture, Forestry, Fisheries, the Environment and Sustainable Development |
| Colombia | Fanny Sierra Bonilla | Asesora de Cooperación Internacional Oficina de Asuntos Internacionales Despacho del Ministro Ministerio de Medio Ambiente y Desarrollo Sostenible |
| Costa Rica | Enid Chaverri | Oficial de Cooperación Internacional Ministerio de Ambiente y Energía |
| El Salvador | Mayra Lourdes Argueta | Gerente de Cooperación Internacional y Seguimiento Ministerio de Medio Ambiente y Recursos Naturales |
| Guatemala (En calidad de observador) |
Juan Carlos Díaz Contreras | Unidad de Cooperación Internacional Ministerio de Ambiente y Recursos Naturales |
| Honduras | Rosibel Martinez Arriaga |
Directora de Cooperación Externa |
| México | Daniela Hernández | Jefa de Departamento de Análisis Internacional en Cambio Climático |
| Nicaragua | Esperanza Rodríguez | Directora General de Cooperación Externa y Proyectos |
| Panamá | Gustavo Padilla | Jefe de la Oficina de Cooperación Técnica Internacional |
| República Dominicana | Rosa Otero | Directora de Comercio y Ambiente |